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脾胃病科于1993年成立，是國家衛生健康委員會臨床重點脾胃病專科；國家區域中醫診療中心培育單位，國家中醫藥管理局“十一五”重點專科，國家中醫藥管理局中醫優勢病種（胃緩·胃下垂）協作組牽頭單位，國家中醫藥管理局第二批中醫診療模式（便秘、消化道腫瘤）創新試點單位，國家藥物臨床試驗機構；福建省中醫脾胃醫學中心，福建省中醫脾胃病重點專科；福建省中醫重點脾胃研究室、實驗室；福建省中醫藥繼續教育項目基地；世界中醫藥學會聯合會消化病專業委員會首任會長，現任名譽會長、副會長，中華中醫藥學會脾胃病分會副主任委員、青年委員會副主任委員，中西醫結合學會消化病分會秘書長，中國醫療保健國際交流促進會中西醫結合消化病學分會副主任委員，中國民族醫藥學會脾胃病分會副會長所屬單位；福建省中醫藥學會脾胃分會、福建省中西醫結合學會消化系統疾病分會、福建省中醫藥學會消化內鏡專業委員會主任委員所屬單位。福建中醫藥大學脾胃研究所掛靠科室。

專科擁有醫生25名，護士29名，其中國醫大師1名，高級職稱人員11名，博士后1名，博士2名，碩士13名，博士生導師2名，碩士生導師7名。開設脾胃病門診、病區及胃腸內鏡室、脾胃研究室（胃腸動力室、呼氣實驗室）、中醫綜合治療室等功能科室。建設有國醫大師楊春波工作室。現有床位 48 張，年均門診量逾 11 萬人次，年收治患者 2000余人次。

專科先后承擔國家“十五”攻關課題、國家自然科學基金課題、福建省衛生廳、科技廳、教育廳等科研課題 40 余項，獲中國中西醫結合學會科技成果獎三等獎一項， 福建省科技進步獎二項，福建省醫藥衛生科技進步獎四項。專科先后創制了清化飲、清腸液、十香止痛貼、七味消脹貼、利膽排石合劑、胃血寧合劑、益胃寧膠囊、健脾清化散瘀飲等 10 種院內制劑。

在專科學術帶頭人國醫大師楊春波教授、專科負責人柯曉主任的帶領下，脾胃病專科已經形成胃腸病、肝膽胰病、消化道腫瘤、消化內鏡四個亞專業方向，已建構建合理的學術人才梯隊。專科突出楊氏脾胃濕熱理論研究及臨床應用；發揮中醫綜合治療在慢性脾胃病中作用；擅長炎癥性腸病、功能性胃腸病、消化道出血等胃腸疾病， 急慢性胰腺炎、膽囊炎、脂肪肝、肝硬化等肝膽胰疾病，消化道腫瘤化療以及胃腸道早癌 EMR、ESD 手術、膽總管結石 ERCP 術以及胃腸道支架置入等疾病的治療；發揮福建省中醫脾胃醫學中心平臺優勢，在消化道大出血、重癥胰腺炎、重癥潰瘍性結腸炎、慢性功能性便秘、膽石癥等危重、疑難疾病的治療上，整合肛腸科、普外科、ICU 等形成多中心協作（MDT)中西并重新模式，把傳統與現代相結合，發揮中醫、西醫兩種醫學優勢，更好為廣大患者服務。